澎湖縣多數國中、小學校辦理營養午餐，遭遇人力、經費、食材採購及營養設計等困難，影響午餐品質，經審計部臺灣省澎湖縣審計室函請研謀改善，澎湖縣政府已自109年第1學期開辦澎南地區學校營養午餐共廚，改善小校辦理困境，提升供餐品質。
審計室指出，受少子女化現象影響，澎湖縣108學年度第1學期國中、小學營養午餐供餐人數未達百人之學校計有40所、1,522人占全縣51所之78.43％，學生數5,557人之27.39％，多數國中、小學校因營養午餐用餐規模小，長期遭遇不易採購等困難，影響學校供餐品質。
然而，審計室於108年11月查核發現，辦理午餐人力不足、不諳菜單營養設計、食材品質不穩及午餐經費不足等為多數學校辦理營養午餐遭遇之困難，部分學校並有影響兼辦午餐教師教學品質情形。參考該縣馬公國民中學學生人數千餘人具一定經濟規模，且進用營養師統一辦理飲食管理，其營養及品質相較其他學校提高，舉如每週提供1至2次在地有機蔬菜、使用未精緻食材比例提高等，及南投縣、嘉義縣等地方政府已採多校共廚供餐或聯合採購食材方式，提高午餐規模，改善偏鄉小校辦理午餐困難等實例，審計室遂於109年1月函請澎湖縣政府研謀改善。
審計室表示，經該室追蹤改善情形，澎湖縣政府已自109年9 月1 0日於五德國小啟動與同位於澎南地區之山水、嵵裡、風櫃國小及澎南國中等4校營養午餐共廚措施，統整人(物)力及經費資源，由專職管理人員辦理午餐共廚事務及監測學生飲食營養狀況，有效減輕教師行政負擔，後續並將擇定其他區域學校實施，以改善小校辦理困境，提升營養午餐品質。