教育部、農業部及文化部所屬國立大學校院及機關，為辦理各項工程，提列工程管理費以支用於工程所需各項管理費用，經審計部教育農林審計處查核發現，部分機關學校將工程管理費支用範疇項目納列於工程契約，並於完工驗收後併入結算，恐增加工程管理費提列數及支出，經函請檢討改善，已將不合規費用改由工程管理費支應。

　　審計處指出，依中央政府各機關工程管理費支用要點第3 點第9 款規定，工程管理費之支用項目包括工程開辦、協調、宣導、民俗及工程爭議之仲裁等所需費用；另行政院公共工程委員會(下稱工程會)104年6月29日工程技字第10400194790號函示，部分機關將工程管理費支用範疇之項目如工程開辦、宣導等納入工程合約併同招標，致增加工程管理費提列數及支出，爰不宜納入工程契約執行。

　　然而，審計處於114年8月查核發現，部分機關學校將工程管理費支用範疇項目如開工、上樑、完工、通水典禮及說明會等活動典禮項目納列於工程契約執行，並於完工驗收合格後併入結算，恐增加工程管理費提列數及支出，並導致部分工程之工程管理費有超支情形，不符中央政府各機關工程管理費支用要點等規定，審計部遂於114年10月29日函請檢討改善。

　　審計處表示，經追蹤改善情形，教育部等機關已於114年12月12日函知所屬機關學校重申工程管理費編列及支用規定，其支用範疇之項目仍以不納入契約為宜；並修訂內部審查流程與控制程序，要求發包前必須嚴格核對工程管理費支用項目；另截至115年7月，將原編列於工程契約之不合規工項費用計1,022萬餘元，改由工程管理費項下支出，有效導正財務秩序。