高雄市輪船股份有限公司(下稱輪船公司)因應高雄市政府(下稱市政府)推行旗津區居民免費乘船政策，辦理旗津卡核(換)發作業，經審計部高雄市審計處查核發現，未適時取具居民戶籍資訊勾核旗津卡使用情形，票證管控未臻落實，經函請研謀改善，已鏈結戶役政資訊並逐月查對票證使用情形。
審計處指出，高雄市旗津區居民優惠乘船實施辦法第3條及第8條規定，乘船證之申請，應檢附最近3個月內設籍旗津區之戶籍謄本等文件向主管機關為之；乘船證使用人有戶籍遷出、死亡或虛報遷徙，主管機關得廢止或撤銷其乘船證。
然而，審計處於112年12月查核發現，輪船公司為應市政府推行旗津區居民免費乘船政策，自102年2月起辦理旗津卡結合高雄捷運一卡通換發作業，尚未申請鏈結戶役政資訊，以勾核旗津卡核發或使用情形，票證管控未臻落實且影響營運收益，審計處遂於113年3月函請研謀改善。
審計處表示，經追蹤改善情形，輪船公司已於113年10月25日完成應用戶役政資訊連結系統之申請，自同年12月起逐月查對旗津卡使用者之戶籍異動資訊(含遷出及死亡)，並實地稽查票證使用情形，期杜絕票證濫用情事，截至114年10月底止，查對失效旗津卡計4,479張，並上傳至票務管理系統予以鎖卡，如以114年度旗津卡使用情形估算，可減少年度營運短絀293萬餘元。