雲林縣政府(下稱縣政府)為維護縣民健康，確保加水站飲用水品質及衛生，訂定雲林縣加水站水源供應許可管理辦法(下稱管理辦法)，經審計部臺灣省雲林縣審計室查核發現，管理辦法未配合中央法規適時修正等，經函請研謀改善，已修正，強化加水站水源管理。
審計室指出，依管理辦法第6條規定，水源水質之檢測方法應以環境部公告之標準檢測方法為之。無公告標準檢測方法者，應依環境檢測標準方法訂定準則第11條規定之檢測方法依序採用。
然而，審計室於113年10月查核發現，管理辦法未訂定供應加水站之水源種類範圍，致無法從源頭把關飲用水安全；又第6條規定水源水質檢測方法，其引用之環境檢測標準方法訂定準則已廢止，管理辦法未配合修正，審計室遂於113年12月函請縣政府督導改善。
審計室表示，經追蹤改善情形，縣政府已於114年5月修正管理辦法，增訂供應加水站之水源種類範圍等相關規範，及修正水源水質檢測方法應以環境部公告之標準檢測方法為之。強化飲用水安全規範及水質檢測準據，以保障民眾飲用水安全衛生。