內政部營建署（下稱營建署）辦理高雄新市鎮開發執行計畫，經審計部查核發現，營建署因經濟、環境條件已產生重大改變，修正該執行計畫，及規劃設置產業專用區，惟因辦理進度延遲，影響產業發展，經函請研謀改善，營建署已於後期開發區設置橋頭科學園區，園區公共工程並於111年7月開工，預計於114年完工，期增加就業機會，促進地區繁榮。
審計部指出，營建署辦理高雄新市鎮開發執行計畫，負責規劃設計開發及營建管理，計畫分為優先發展區（已開發區）、第1期發展區及後期發展區，計畫期程為81至106年，主要規劃住宅區及商業區用地，以紓解高雄市都會區都市成長壓力。
然而，審計部於108年9月查核發現，營建署為開發新市鎮內捷運沿線土地，與高雄市政府於101年1月間修正上開開發執行計畫。惟該署耗時5年餘始與高雄市政府達成確認開發主體、經費分擔等；且於105年即知悉高雄地區產業用地有供不應求情況，仍未依經濟部工業局分析檢討結果，規劃產業專用區，俟107年7月獲行政院指示，始將高雄新市鎮後期發展區規劃設置橋頭科學園區，迄108年底實際僅完成高雄新市鎮第1期發展區開發業務，後期發展區土地面積約999公頃仍待開發情事，審計部遂於109年4月函請內政部查明妥適處理。
審計部表示，經追蹤改善情形，營建署業已修正開發執行計畫，並陳報行政院於109年9月28日核定後，依據該計畫辦理高雄橋頭科學園區開發案，園區公共工程並已於111年7月開工，預計114年完工，期滿足產業發展所需用地，並促進居民在地就業，帶動地區繁榮。