審計部臺灣省新竹市審計室(下稱新竹市審計室)查核發現，新竹農產運銷股份有限公司(下稱新竹農產公司)辦理蔬果農藥殘留檢驗作業，抽驗比率偏低，且抽驗對象未具代表性，相關規範未臻周全，經促請檢討改善，已修正作業規範，強化檢驗成效及代表性，落實防堵殘留農藥蔬果流通消費市場，提升農產食品安全。
新竹農產公司為竹竹苗地區主要農產品運銷流通中心，新竹農產公司為減少上市農產品農藥殘留風險，維護消費者健康，依「新竹農產公司交易蔬果農藥殘留檢驗作業規範」(下稱作業規範)進行蔬果農藥殘留抽驗。據作業規範第3點及第4點規定，進場交易之蔬果，由檢驗人員依業者登記冊輪流抽驗。新竹市審計室於108年5月查核發現，新竹農產公司107年度辦理蔬果農藥殘留檢驗4,916件，計抽驗70位承銷人及1個臨時承銷(下稱農民區)攤位，分別占431位分貨場登記營業承銷人及34個農民區攤位之16.24％及2.94％，抽驗比率偏低。又上開作業規範未考量各業者交易數量多寡產生之農藥殘留風險差異，且未將農民區攤位納列為抽驗對象，規範未臻周全，經於108年6月10日函請檢討改善。
嗣經新竹市審計室追蹤改善情形，新竹農產公司業於108年7月19日修正作業規範，將抽驗對象修正為依供應人蔬果進貨明細表及農民區輪流抽驗。經新竹農產公司統計自修正規範後至109年6月底止，新竹農產公司業辦理蔬果農藥殘留檢驗4,716件，抽驗100位承銷人，占承銷人總數之25.06％，對農民區抽驗8攤位，占農民區攤位數之23.52％，強化蔬果農藥殘留檢驗成效及代表性，落實防堵殘留農藥蔬果流通消費市場，提升農產食品安全，維護民眾健康。