審計部及所屬教育農林審計處暨交通建設審計處，掌理中央政府及其所屬機關之審計事務；另審計部於直轄市，設有臺北市、新北市、桃園市、臺中市、臺南市、高雄市6個審計處，並於臺灣省各縣市及福建省金門縣，設有15個審計室，分別掌理各該地方審計事務。