民國105年5月3日署名「魚凱」公務員以「給林全院長的一封信—公務員也想實踐夢想」為題投書媒體，針對嘉義縣民雄鄉動物收容所因非常難編列運送收容犬預算，採省錢不人道的運送方式，致途中部分犬隻死亡，及單位採購人員寧願選擇較保守安全的方式進行採購，以避免被質疑圖利特定廠商等情，質疑審計防弊的制度，已讓許多業務動彈不得，產業發展需要政府政策的支持，卻反被審計綑綁等。
按直轄巿及縣(巿)地方總預算編製要點規定，直轄市、縣（市）政府應設年度計畫及預算審核會議，召集相關局、處首長審查收支核計、各類支出分配及優先順序等事項。爰嘉義縣民雄鄉動物收容所於年度開始前，應縝密檢討妥善規劃運送收容犬計畫及預算需求，循程序提送嘉義縣政府年度計畫及預算審核會議審查，嗣由該縣府主計處併同各機關預算案彙編成總預算案，陳報縣長提報縣議會完成審議後，據以執行；年度中如因原編預算不敷，亦應循程序辦理經費流用、提出追加預算、或申請動支第二預備金支應。報載投書稱民雄收容所因非常難編列預算，而採節省運送方式，致部分收容犬生命損失等，係地方政府預算編列與執行層面問題，實與審計制度無關。
另政府採購法規定，機關辦理採購得採行「最有利標」或「最低標」等決標方式，同時規定應依功能或效益，擬定技術規格及招標文件，因此機關擬採用何種決標方式、工法及技術規格，係屬其行政權責應行決定事項，審計機關稽察各機關採購案件，係查核其辦理程序是否符合政府採購法規定，對其採用之工法/技術/材料未予干預，尚無審計綑綁之情。
又審計部於民國104年6月18日曾就行政院公共工程委員會推動統包採購導入創新工法/技術/材料，提出「適度調整統包工程推動方式，並研議逐步引進『制訂服務成果規範』等作法，以降低機關監督管理負擔，促使廠商積極研發新技術，達成提升營造產業全球競爭力之目標」等建議，對機關將創新工法/技術/材料導入政府採購，樂觀其成。審計機關將持續針對相關採購制度規章研提有關建議意見，促使法制更臻周延，並提升政府採購效能。