內政部國家公園署（下稱公園署）為協助太魯閣國家公園管理處執行0403花蓮地震復原重建工作，震後旋即成立災後復建專案小組，並訂定「內政部國家公園署0403花蓮地震災後復建專案小組組織及作業要點」（下稱復建專案小組作業要點）。經審計部查核發現，部分災後重建工程執行進度落後，經函請檢討改善，已訂頒工程督導原則，強化進度管考與現地督導業務，俾利督導各管理處有效推動工程進度。
審計部指出，復建專案小組作業要點明定公園署為協助太魯閣國家公園管理處（下稱太管處）執行轄區災後復原重建工作，特設0403花蓮地震災後復建專案小組，協助及督導太管處執行災後復原重建工作。
然而，審計部於114年9月查核發現，太管處辦理「0403太魯閣遊客中心及周邊設施緊急災修工程」與「九曲洞地區搶災復建工程」等2件災後重建工程執行進度落後，惟公園署未適時協助改善及加強督導，有欠周妥。審計部遂於115年1月函請研謀妥處。
審計部表示，經追蹤改善情形，太管處辦理上述2件災後重建工程已完工驗收，並陸續分區開放遊憩；另公園署已於115年3月2日訂頒「內政部國家公園署辦理工程督導原則」，以強化進度管考與現地督導業務，俾利督導各管理處有效推動工程進度。