金門縣衛生局(下稱衛生局)設立金門縣醫療作業基金(下稱醫療作業基金)，提供轄內民眾醫療服務，經審計部福建省金門縣審計室查核發現，尚未訂定藥品使用及管理規定，經函請研謀改善，已訂定，健全藥品管理機制。
審計室指出，衛生局為強化辦理公共衛生業務及民眾醫療服務，設立醫療作業基金，於金城鎮、金湖鎮、金沙鎮、金寧鄉、烈嶼鄉等5處衛生所設置主任醫師或支援醫師，就近滿足民眾醫療需求，並藉由醫療資訊系統(Healthcare Information System,HIS)管理各衛生所自衛生福利部藥品聯合招標採購契約購置之藥品。
然而，審計室於114年4月查核發現，截至114年3月底止，衛生局尚未訂定醫療作業基金之藥品管理作業規定，供各衛生所辦理藥品管理作業遵循，亦未界定該局與各衛生所權責，致未能有效監督各衛生所藥品管理是否完善，及適時提供建議改善意見，審計室遂於114年5月函請研謀改善。
審計室表示，經追蹤改善情形，衛生局已於114年6月26日訂定金門縣衛生局所屬衛生所藥品使用及管理作業規定，並由該局相關單位組成督導小組，每年將不定期前往各衛生所稽查藥品採購及庫存情形，精進各衛生所藥品管理作業，確保用藥安全，避免藥品存量不足，或過剩形成過期損耗之資源浪費情形，健全藥品管理機制。