教育部所屬國立臺灣大學醫學院附設醫院（下稱臺大醫院）、國立成功大學醫學院附設醫院（下稱成大醫院）、國立陽明交通大學附設醫院（下稱陽明交大醫院）分別訂定醫療欠費催收處理要點，經審計部查核發現，該3院因相關要點未臻周延或實務作法與規定有間，影響債權憑證清理，經函請教育部督促研謀改善，已修正相關規定。
審計部指出，臺大醫院、成大醫院、陽明交大醫院為妥善處理應收醫療帳款及債權憑證，分別訂定「國立臺灣大學醫學院附設醫院暨分院醫療費用欠款催收處理原則」、「逾期欠款債權催收款處理要點」及「國立陽明大學附設醫院應收醫療帳款處理要點」，俾使應收醫療帳款作業有所準據。經統計該3院108至112年度經管債權憑證計1,551件、金額6,514萬餘元。
然而，審計部於113年4月查核發現，臺大醫院、成大醫院、陽明交大醫院經管債權憑證件數繁多，各院作法間有出入，其中臺大醫院未規範債權憑證清查頻率及強度，且各分院清查方式不一；成大醫院依債權金額多寡，訂有不同清理頻率；陽明交大醫院未依規定頻率，辦理財產查調作業等，為免債權憑證經年累增，加重管理負擔並影響清理成效，審計部遂於113年5月函請教育部督促檢討改善。
審計部表示，經追蹤改善情形，臺大醫院、成大醫院、陽明交大醫院為提升債權憑證管理行政效能，已分別於113年12月及6月、114年1月修正債權憑證管理規範及醫療欠費處理要點，以強化債權憑證管理及落實欠費催繳作業。