國防部海軍司令部為管理軍艦維修狀況，建置維修管理系統（MDS），由海軍所屬單位分層管理，按艦艇維修週期自動編排艦艇交修計畫、管制交修狀況，經審計部查核發現，海軍所屬單位未落實登錄與回饋資料，監督及管理單位亦未督促確實辦理，經函請檢討改善，已強化艦艇交修管制機制。
審計部指出，依海軍後勤資訊(船艦、MDS)作業程序規定，MDS系統建置交修計畫自動排程、編修與核定功能，依修護手冊各型艦艇維修週期，據以計算各修護單位年度修艦負荷，及按各修護單位回饋艦艇實況交修資訊，掌握艦艇計畫與實況交修之差異。
然而，審計部於112年度查核發現，MDS系統之交修管制檔欠缺107年度以後之艦艇預定及實際進廠、完工日期等資料，未能運用交修計畫子系統功能自動排程交修計畫，審計部遂於113年1月函請國防部督促海軍司令部檢討改善。
審計部表示，經追蹤改善情形，海軍司令部已完成112年1月以後資料補登，並律定各單位權責及登載、查證時機，由海軍司令部後勤處督管所屬單位詳實登載艦艇修護相關資料，定時實施線上稽核，以強化艦艇交修管制機制。