教育部為整合所屬機關電腦機房及提升資訊安全，辦理綠能雲端資料中心(下稱雲端資料中心)設置計畫，整併部分所屬機關資訊系統，向上集中至雲端資料中心，審計部教育農林審計處查核發現，該雲端資料中心未能如期完工啟用，且系統向上集中及實體主機減少數量未達預計目標，經函請行政院督促檢討改善，該雲端資料中心已完工啟用，並上傳所屬機關資訊系統，提升整體資安防護效益。
審計處指出，教育部規劃設置雲端資料中心，採統包方式辦理，預計於108年8月20日完工啟用，109年底整併體育署、青年發展署等7個所屬機關80％系統及減少20％實體主機，向上集中至雲端資料中心，透過資訊資源集中共享，以提升資訊安全。
然而，審計處於111年3月查核發現，教育部未督促專案管理廠商妥為管控統包商設計作業期程等，延宕執行進度，截至111年3月底止，已耗資3,639萬餘元建置雲端資料中心，仍未完工啟用；復未依計畫推動策略積極執行，系統向上集中及實體主機減少數量比率僅6.13％及13.41％。審計處遂於111年5月24日函請行政院督促檢討改善。
審計處表示，經追蹤改善情形，教育部雲端資料中心已於111年底完工啟用；另截至113年底止，該部及7個所屬機關重新盤點應集中系統數計202個，已有171個系統向上集中，比率84.65％；實體主機數計33臺，較原本156臺減少123臺，比率78.85％，有效整併資訊系統，提升整體資安防護效益。