嘉義市政府（下稱市政府）暨所屬嘉義魚市場股份有限公司（下稱魚市場公司）辦理嘉義魚市場設施改善工程，經審計部臺灣省嘉義市審計室查核發現，魚市場公司因遮雨棚設計型式無法取得建造執照，致廠商申請解除契約，迄111年底止，逾4年9個月仍未動工，較計畫期程大幅落後，經函請檢討改善，已重新發包施工，於113年5月22日完工啟用，提升營運品質。
審計室指出，魚市場公司考量嘉義魚市場於104年10月8日遷往嘉義市農漁產運銷物流中心，為因應未來營運需求，獲市政府於107年3月23日核定補助經費1,500萬元，連同自籌款1,000萬元，共計2,500萬元，辦理嘉義魚市場設施改善工程，預計111年4月21日完工。
然而，審計室於112年1月查核發現，市政府於107年3月23日核定魚市場公司辦理嘉義魚市場設施改善工程，魚市場公司並未評估確認遮雨棚設計型式是否符合建築技術規範，致該工程於110年4月21日決標後，無法取得建造執照而未能開工，廠商以遲未收到開工通知及考量原物料大幅上漲為由，於110年12月27日向魚市場公司申請解除契約，市政府亦未善盡監督控管及協調職責，積極協助魚市場公司解決設計問題，迄111年底止，逾4年9個月仍未動工，較計畫期程大幅落後，未能達成改善魚市場環境之預期目標，審計室遂於112年6月函請嘉義市市長督促檢討改善。
審計室表示，經追蹤改善情形，市政府已督促魚市場公司積極辦理工程解約後重新發包作業，於111年12月13日決標，並由該府智慧科技處列管執行進度，工程已於113年5月22日完工啟用，有效改善魚市場環境，提升營運品質。