臺南市政府環境保護局(下稱環保局)配合行政院環境保護署(下稱環保署)「垃圾零廢棄」政策，辦理廚餘回收再利用工作，經審計部臺南市審計處查核發現，臺南市108至110年度廚餘回收量逐年減少，且垃圾中廚餘含量比率偏高，經函請檢討改善，已增加廚餘回收量，減少焚化負荷與污染。
審計處指出，環保署為促進資源循環再生及推動垃圾強制分類計畫，將垃圾區分為「資源」、「廚餘」與「一般垃圾」等3類，並提出「垃圾零掩埋、資源全回收」之願景，環保局為配合「垃圾零廢棄」政策，辦理廚餘回收再利用工作，公告廚餘為應回收物，推行強制分類，並執行再利用，以減少環境髒亂問題，降低垃圾處理負擔。
然而，審計處於111年3月查核發現，臺南市108至110年度廚餘回收量分別為63,345公噸、61,417公噸、57,851公噸，逐年下降，且110年度收運垃圾性質分析結果，其中廚餘約占12.02％，廚餘直接焚化處理，將降低焚化廠燃燒效率且產生戴奧辛及增加底渣垃圾等，造成垃圾處理系統嚴重負擔，影響焚化爐運轉效能，審計處遂於111年5月函請環保局檢討改善。
審計處表示，經追蹤改善情形，環保局除加強分類宣導，並隨垃圾車加強廚餘瀝水及相關分類工作，111年度廚餘回收量計57,937公噸，已較110年度增加，且垃圾性質分析結果，其中廚餘約占7.51％，將持續提升廚餘回收量，減少焚化負荷與污染。