行政院農業委員會種苗改良繁殖場（下稱種苗場）辦理綠肥種子採購及銷售業務，經審計部教育農林審計處查核發現，種苗場採購種子契約發芽率標準與種苗場逾齡及不良種子處理要點（下稱不良種子處理要點）不一致；種苗場綠肥種子配售要點（下稱配售要點）未配合販售品項及時修正，不利新品項種子推廣，經函請檢討改善，種苗場已於112年3月16日修訂不良種子處理要點及配售要點，以確保採購種子品質及提升推廣成效。
　　審計處指出，種苗場主要業務之一係配合政策生產供應各項優良種子，其中為處理逾齡及不良種子，以提高推廣種子品質，訂定不良種子處理要點；為辦理綠肥種子推廣，訂定配售要點，明定各項綠肥種子包裝規格及單位農地種子使用量，以符合申購者實際需求，避免貯放不當或延遲種植而引起品質劣變或發芽不良。
　　然而，審計處於111年10月查核發現，種苗場綠肥作物埃及三葉草種子採購合約中，種子發芽率合格標準為80％，與 105年9月5日修正之不良種子處理要點所定發芽率標準85％不一致；該場107年至111年10月底止銷售綠肥品項，紫雲英、百日草、向日葵、大波斯菊及蕎麥等5項未列載於配售要點中，列明其包裝規格及種子使用量，不利新品項種子推廣，審計處遂於112年2月14日函請種苗場檢討改善。
　　審計處表示，經追蹤改善情形，種苗場已參考有關文獻及實務經驗，於112年3月16日修正不良種子處理要點，調整埃及三葉草發芽率標準至80％，並將苕子及紫雲英發芽率標準由75％調高至80％，暨新增百日草及大波斯菊發芽率標準，以提供農業政策所需之優良種子；修正配售要點，增列綠肥作物新品項之包裝規格及單位農地種子使用量，以滿足申購者使用需求，提升推廣成效。