台灣糖業股份有限公司（下稱台灣糖業公司）為提升東海豐畜殖場養豬效能及改善周遭環境品質，辦理負壓水濂及綠能設計豬場改進計畫（下稱東海豐畜殖場改進計畫），經審計部查核發現，該畜殖場實際畜養空間不足，無法容納原規劃最大在養數，肉豬年產量未達計畫目標；又場內外豬隻排泄物等料源供應不足，連帶影響區域沼氣中心發電量能，經函請檢討改善，已採行相關具體改善措施，增加肉豬年產量，並增設管線接收外部料源，提高發電量能。
審計部指出，台灣糖業公司為落實農業循環經濟，同時考量東海豐畜殖場畜舍設備老舊、畜殖產能等問題，及兼顧環境保護及降低異味產生等效能，辦理東海豐畜殖場改進計畫，冀提升畜殖場養豬效能及改善周遭環境品質。
然而，審計部於110年12月查核發現，東海豐畜殖場耗資6億941萬餘元進行改建，惟統包工程服務建議書設計豬舍規模與固定資產專案投資計畫、招標文件之需求說明書未相符，肇致畜養空間不足，110年實際養成肉豬37,004頭，未達契約年產40,635頭及投資計畫42,370頭目標；又毗鄰畜殖場豬隻排泄物及農業廢棄物之平均每日供應量24.13噸，僅占原計畫處理量100噸之24.13％，沼氣中心年發電量115萬餘度，未達計畫目標，審計部遂於111年2月函請經濟部督促檢討改善。
審計部表示，經追蹤改善情形，台灣糖業公司已研擬具體改善措施，截至112年3月底止，該場肉豬年產量提升至38,011頭，平均每日外部料源供應量增加至42.4噸，沼氣中心年發電量由110年之115萬餘度提高至135萬餘度，逐步發揮環境保護及提升經營績效等計畫效能。