經濟部水利署(下稱水利署)為加強石門水庫防淤及排洪能力，興建阿姆坪防淤隧道以提升水庫庫容。經審計部查核發現，該工程因廠商施工人力不足及工程材料調度耽延、隧道開挖地質不確定性等影響，致工程進度落後，經函請檢討改善，已督請廠商妥善安排人力及機具，加速工進，該工程已於112年2月竣工，有效降低水庫遭受泥砂淤積所帶來之危害，並延續水庫壽命。
審計部指出，石門水庫為臺灣北部地區重要水庫之一，水利署為加強石門水庫防淤及排洪能力，於庫區中游阿姆坪興建防淤隧道，主隧道長3,702公尺，工程經費約36.58億元，於106年11月開工，預計110年底完工，完工後每年約可增加水庫64萬立方公尺的防淤能力，以及增加水庫每秒600立方公尺排洪量，並可降低傳統清淤運輸交通與空污衝擊，節省大量運輸成本。
然而，審計部於111年4月查核發現，該工程原定於110年12月31日前完工，惟因廠商施工人力不足與工程材料調度耽延、隧道開挖地質不確定性、有害氣體滲出，及受新型冠狀病毒肺炎 (COVID-19) 疫情等影響，展延完工期程至111年底，較原訂目標落後1年，審計部遂於111年6月9日函請水利署研謀改善措施。
審計部表示，經追蹤改善情形，水利署(北區水資源局)已督請廠商妥善安排人力、機具及調整施作工序趲趕工進，其中隧道工程經持續趕工，並於111年9月配合軒嵐諾颱風來襲適時進行沖淤操作，業於112年2月13日竣工，未來除有助於水庫穩定供水，更可降低水庫泥砂淤積帶來之危害，並延續水庫壽命。