臺南市政府衛生局(下稱衛生局)所轄37個區衛生所個別辦理臨床醫事檢驗委託服務採購，經審計部臺南市審計處查核發現，同一檢驗項目存有單價不一，甚有同一家檢驗所(診所)之同項檢驗向不同衛生所收取之檢驗單價不同等情事，經函請檢討改善，已改採集中採購複數決標方式辦理，提供各衛生所擇選優良廠商，降低檢驗費用及減少重複採購作業之時間與人力，提升採購效率。
審計處指出，衛生局為應各衛生所門診醫療及預防保健採檢業務所需，於109年度編列512萬元由各衛生所自行委託檢驗所或診所代為檢驗檢體，並提供檢驗報告，除東區等5區衛生所由衛生局代辦採購外，其餘32區衛生所係自行辦理採購。
然而，審計處於109年9月查核發現，各衛生所委託檢驗所或診所辦理之15項檢驗項目，存有同檢驗項目單價差異介於1.17至6倍之間，甚有同一家檢驗所或診所向不同衛生所收取之檢驗單價亦不同，審計處遂於109年11月函請檢討改善。
審計處表示，經追蹤改善情形，衛生局已參考108至110年度各衛生所檢驗費用之平均單價及中央健康保險署給付之檢驗費，訂定各檢驗項目之合理單價，並於110年12月由該局以集中採購複數決標方式，分由3家廠商得標承作，自111年1月起各衛生所可依共同供應契約實施辦法與廠商進行訂購，減少重複採購作業之時間與人力，並避免各項檢驗費用有數倍價差情事，同年12月28日已完成112年續辦醫事檢驗服務集中採購作業，提升採購效率。