臺東縣政府(下稱縣府)辦理臺東縣垃圾焚化廠興建及營運計畫，經審計部臺灣省臺東縣審計室查核發現，縣府未依原定期程完成營運監督及回饋金管理相關規定之訂修，經函請研謀改善，已訂定及修正相關規定，有助健全焚化廠營運後之監督及回饋金管理機制，並促進政府資訊公開透明。
審計室指出，臺東縣焚化廠前經行政院於101年11月同意為備用設施迄未營運，然該縣公有垃圾衛生掩埋場計有13處，其中8處已飽和或曾發生火災而無法使用，其餘5處將陸續飽和，處理量能逐年減少，為避免發生垃圾無處去之窘境，縣府於108年7月向行政院環境保護署爭取經費5.63億元，辦理臺東縣廢棄物能資源中心效能提升計畫，改善並重新啟用臺東縣焚化廠，預計111年上半年試俥。
然而，審計室於110年4月查核發現，縣府規劃於焚化廠營運前成立操作營運監督委員會，監督該廠回饋計畫、綠化工作及二次公害防治等事項，並於109年下半年先完成相關規定之訂修，惟未依原訂期程完成，有影響日後營運之虞，審計室遂於110年5月函請研謀改善。
審計室表示，經追蹤改善情形，縣府於111年3月進行焚化廠設備試俥，預計於112年2月啟用營運，初估營運後每年回饋金約1,600萬元，將專款專用補助臺東市民家戶水電費，並於111年5月23日訂定臺東縣垃圾焚化廠營運階段回饋金管理運用辦法，及於111年5月30日修正臺東縣垃圾焚化廠操作營運監督委員會設置要點，該委員會並召開會議執行焚化廠試俥期間污染防治之監督，健全焚化廠之監督及回饋金管理機制，並促進政府資訊公開透明。