台灣糖業股份有限公司精緻農業事業部（下稱台糖公司精農事業部）投資溫室以企業化經營方式培育蝴蝶蘭，主要銷售歐美等國家，經審計部查核發現，該事業部對蝴蝶蘭生產及品種研發管理流程，間有未臻完善，經函請台糖公司檢討改善，已改造瓶苗生產流程管控，降低蘭苗淘汰率，提高蘭苗育成出瓶率，並聚焦生產銷售占比較高之品種，以提高生產效率；另調整品種權申請策略，確保研發成果。
審計部指出，隨著國內經濟轉型及國際糖價長期低迷，台糖公司精農事業部利用閒置廠房設置溫室蘭園，並以栽培蝴蝶蘭為主。該事業部致力於蝴蝶蘭品種研發，每年生產高品質蝴蝶蘭苗，外銷到日本、加拿大、美國和歐洲各國。
然而，審計部於110年10月查核發現，台糖公司精農事業部培育蝴蝶蘭之蘭苗總淘汰率10.55％，瓶苗出瓶率75.47％，與業界瓶苗出瓶率水準90％相比，不具競爭優勢，且生產蝴蝶蘭品種眾多，成本降低不易，又歷年蝴蝶蘭品種研發尚無獲得品種權專利等研發成果，審計部遂於111年1月10日函請台糖公司檢討改善。
審計部表示，經追蹤改善情形，台糖公司精農事業部已改造瓶苗生產流程管控，111年度上半年蘭苗總淘汰率已由10.55％降低至1.96％，蘭苗育成出瓶率由75.47％提高至90.57％，並聚焦生產V3、Ama、Anna等3個品系，占總銷售量之55.77％，提高生產效率，降低蘭苗平均生產成本約36.92％；另已向行政院農業委員會農糧署申請6個自行研發培育之蘭花品種登錄，待後續開花，即可取得品種權專利，確保研發成果。