臺南市政府農業局(下稱農業局)辦理轄內野生動物救傷情形，經審計部臺南市審計處查核發現，農業局補助民間團體辦理野生動物救傷作業，未明確規範救傷動物物種，亦未定期追蹤後續收容及野放處理情形，經函請研謀改善，已訂定臺南市野生動物救傷處理流程，並進行收容機構照養野生動物飼養訪視與稽核，提供專業緊急救援及醫療照護，以適切保障野生動物獲得妥適照顧。
審計處指出，農業局委託臺南市野鳥學會及臺南市野生動物保育學會(下稱保育學會)辦理野生動物救傷與收容業務，當該局接獲民眾通報發現受傷野生動物時，即通知野鳥學會或保育學會前往接收受傷野生動物，進行治療使其復原後進行野放，無法野放者則繼續照養至死亡。
然而，審計處於110年11月查核發現，農業局未明確規範救傷動物物種，致有經行政院農業委員會列為移除對象之外來入侵種陸生動物(如綠鬣蜥) 仍予救援情事，另未定期追蹤後續收容及野放處理情形，亦未定期稽查或評鑑委託救傷收容機構，審計處遂於111年1月函請農業局研謀改善。
審計處表示，經追蹤改善情形，農業局已於111年3月24日訂定臺南市野生動物救傷處理流程，提供民眾及合作救傷機構執行野生動物救傷之依循，並委託野鳥學會、頑皮世界野生動物園執行救傷處理及收容、安置，讓野生動物可儘快重返棲地，另規劃於每年6及12月間進行收容機構照養野生動物飼養訪視與稽核，以適切保障野生動物獲得妥適照顧。