雲林縣政府(下稱縣政府)為加強經管專戶存管款項之管理，訂定雲林縣政府及所屬各機關學校專戶存管款項管理要點，經審計部臺灣省雲林縣審計室查核發現，部分專戶未列帳管理，管控機制存有疏漏，經函請檢討改善，該府已督促各機關檢討專戶使用情形，並清理無存續必要之專戶，完善專戶管理作業。
審計室指出，縣政府為強化公庫專戶管理，訂定雲林縣政府及所屬各機關學校專戶存管款項管理要點，規定各機關學校對專戶使用情形，每年應自行檢討一次，對於專戶處於靜止狀態達一年以上者，應積極清理。專戶設立原因消滅時，應即辦理銷戶。
然而，審計室於109年10月查核發現，部分多年未曾異動之專戶無帳可稽，其中甚有排水改善補償專戶存有餘額75萬餘元，該府未能確實掌握經管專戶帳款收支情形，內部作業存有疏漏，審計室遂於110年1月函請縣政府積極檢討辦理。
審計室表示，經追蹤改善情形，縣政府除於110年2月24日函請各該專戶管理機關及學校就專戶使用情形進行檢討外，並逐一釐清各專戶存款收支情形；另就上開已無存續必要性之排水改善補償專戶，辦理銷戶及結清餘額75萬餘元，以落實專戶管理，確保公款安全。