嘉義縣家畜疾病防治所(下稱家畜疾病防治所)為改善動物收容環境，鼓勵民眾認養，並對具攻擊性流浪犬隻實施強化精準捕捉，訂有「嘉義縣公立動物收容處所管理作業規範」作為執行準據，惟經審計部臺灣省嘉義縣審計室查核發現，收容動物之認養量偏低，部分具攻擊性犬隻絕育後又放回，動物收容管制業務未臻周妥，經函請檢討改善，除民眾認養數量已逐漸提升外，並加強犬隻捕捉、絕育及安置等工作，落實動物保護及保障民眾安全。
審計室指出，家畜疾病防治所為因應重建動保教育園區，於108年9月向民間租借臨時收容所，改善收容環境，積極推廣民眾認養，並成立遊蕩犬隻強化精準捕捉專線，加強捕捉具攻擊性犬隻，避免其咬人追車，影響民眾安全。
然而，審計室於108年11月查核發現，該所官方網頁公告收容場址及民眾預約認養時間等資訊未即時更新，108年度截至10月底止僅認養78隻，收容139隻已較臨時收容所可收容量110隻，增加29隻；捕捉具攻擊性、咬人追車犬46隻，其中20隻絕育後又放回，無法有效解決犬隻咬人或追逐人車等問題，審計室遂於108年12月函請家畜疾病防治所積極檢討改善。
審計室表示，經追蹤改善情形，家畜疾病防治所除更新官方網頁相關資訊外，並積極宣導推動「浪愛友嘉」認養等專案，109年度完成認養263隻；另成立「動物保護管制隊」盤點遊蕩犬出沒熱區，進行捕捉、運送、絕育及後續安置評估工作，109年度計捕捉收容具攻擊性犬隻224隻，全數收容或送民間狗場收養，有效保障民眾安全。該所109年度動物收容管制業務經行政院農業委員會評鑑結果，獲優等及進步獎，為非6都進步幅度最大縣市。