嘉義縣政府所屬地政事務所辦理地籍清理第2期實施計畫(下稱地籍清理計畫)，清查轄內權屬不明之土地及建物，經審計部臺灣省嘉義縣審計室查核發現，其中「流水編之登記名義人」一類，嘉義縣尚未完成清理筆數達12萬6,174筆，案件量偏高，亟待加速清理，經函請檢討改善，已督促所屬加強運用跨機關資訊蒐集及透過多元管道查對資料，提升整體清理績效。
審計室指出，內政部考量地籍清理計畫將於108年底結束，乃於108年11月29日召開地籍清理業務工作會報，促請地方政府賡續清理各類土地，期於114年底達成清理(扣除公共設施用地)比率90％之目標。
然而，審計室於109年3月間查核發現，各直轄市、縣(市)政府依地籍清理條例規定辦理14類土地及建物之清查及公告，其中「流水編之登記名義人」一類，嘉義縣尚未完成清理筆數達12萬6,174筆，居全台之冠，以該府預計每年平均清理6,000筆設算，須至129年度方能完成清理。嗣經審計室運用該府經管全國土地基本資料庫篩選出登記名義人無登載統一編號之土地及建物，比對財政稅務局地方稅系統稅務資料庫結果，其中已建置所有權人基本資料者，計有3萬4,527筆，審計室遂於109年4月提供比對結果函請嘉義縣政府督促所屬地政事務所積極檢討改善。
審計室表示，經追蹤改善情形，嘉義縣政府業於109年6月督促所屬善加利用跨機關資訊之蒐集，並積極輔導事業單位辦理更正登記，經統計109年度已完成清理件數達1萬4,119筆(棟)，較當年度目標件數6,000筆(棟)，增加8,119筆(棟)，有效提升清查效率，縮短清理時程。