行政院原子能委員會核能研究所（下稱核能研究所）核醫製藥中心為國內唯一具規模且合法供應核醫藥物之政府機構，經審計部查核發現，該中心面臨核心設備設施老化、產能偏低、人員離退、人力短缺等困境，經函請核能研究所就問題癥結研謀妥處，已規劃分年補充短缺人力及編列預算汰換老化設備零組件，以精進迴旋加速器核心設備設施。
審計部指出，核能研究所於86年正式成立核醫製藥中心，專責生產核醫藥物，擁有國內唯一中型迴旋加速器與醫用同位素研製設施，為國內唯一具規模且合法供應核醫藥物之政府機構，可協助國內生技業者臨床試驗及查驗登記之申請及執行，加速新藥開發，並穩定提供國內核醫藥物需求。
然而，審計部於109年3月查核發現，中型迴旋加速器自82年啟用已20餘年，週邊相關設施老化，核醫製藥中心為避免維修停機改採零售方式接單生產，惟實際生產線多處於閒置狀態，未能充分發揮應有之效能；又該中心正面臨編制人員退休潮，復因產能不足售藥收入下降，長期營運結果，面臨核心設備設施老化、產能偏低、人員離退、人力短缺之窘境，益顯核醫製藥中心及核心設施運轉之困難，遂於109年6月函請核能研究所就問題癥結研謀妥處。
經審計部追蹤改善情形，核能研究所業規劃分年補充核醫製藥中心短缺人力，及編列預算汰換老化設備零組件以精進迴旋加速器核心設備設施，核醫製藥中心已於109年間增加2名新進人員，預計於110年完成加速器運轉人員訓練取得運轉人員執照，並每年持續進行藥廠GMP人員訓練；又該所已於110年編列預算2,000萬元，預計完成迴旋加速器射頻系統主放大器組件更新，有助技術及經驗傳承，暨核醫藥物之研發與製造。