新北市政府漁業及漁港事業管理處(下稱漁管處)為應萬里地區傳統漁撈漁業需求，於萬里漁港提供漁民暫時存放捕撈魚貨之場所，經審計部新北市審計處查核發現，萬里漁港魚貨處理廠完工後逾1年11個月仍無法提供漁民暫存魚貨，經函請檢討改善，已改善魚貨處理廠管線相關設施並開放漁民使用，發揮使用效能。
審計處指出，漁管處為應萬里地區傳統漁撈漁業需求，於106年6月間辦理萬里漁港魚貨處理廠整建工程，建置魚貨暫存保鮮空間及相關水電設施，提供漁民暫時存放捕撈魚貨。
然而，審計處於108年10月查核發現，整建工程於106年11月3日完工，卻因魚貨處理廠實際設置之冷凍櫃數量較規劃為多，室內管線配置量不足，須寬籌經費改善，迄108年10月底仍無法提供漁民暫存魚貨使用，審計處遂於109年1月函請漁管處研謀改善。
審計處表示，經該處追蹤改善情形，漁管處已於109年2月完成配置及改善萬里漁港魚貨處理廠管線相關設施，並委託萬里區漁會管理及訂定後續管理辦法與使用契約，截至109年10月底止，該魚貨處理廠已開放9處倉儲區供漁民暫存捕撈魚貨，發揮設施使用效能。