審計部查核發現，台灣自來水股份有限公司（下稱台水公司）為減輕工程施作對環境造成負面影響，訂定生態檢核落實執行計畫，惟相關內容未明訂資訊公開及公民參與方式，錯失機關與公民團體運用生態檢核作業資訊溝通交流機會，經函請該公司檢討改善，業已建立公民參與機制，以促進生態環境保育。
審計部指出，行政院公共工程委員會基於政府辦理公共工程應注重生態保育，於108年5月10日函頒「公共工程生態檢核注意事項」，要求各工程主辦機關辦理新建工程落實檢核作業，以維護生物多樣性資源與環境友善品質，並可依個案工程及生態環境特性，自行增補訂定檢核自評項目。台水公司爰依自來水設施工程特性，於109年2月12日訂定該公司生態檢核落實執行計畫，提供所屬遵循。
然而，審計部於109年4月查核發現，台水公司生態檢核落實執行計畫並未依上開注意事項納入資訊公開之規定；復因生態檢核作業執行情形資訊未盡透明，錯失機關與公民團體溝通交流機會，經於109年6月8日函請檢討改善。
審計部表示，經該部追蹤改善情形，台水公司檢討原有生態檢核落實執行計畫相關規範，於109年6月20日另頒生態檢核執行作業要點，並納入公民參與方式及程序，建立公民參與機制，自109年8月4日起，於該公司全球資訊網首頁設置生態檢核專區，即時上傳生態檢核各階段相關資料，提升資訊公開程度及公民參與機會，以促進生態環境保育。