審計部臺中市審計處(下稱臺中市審計處)查核發現，臺中市海岸資源漁業發展所(下稱海資所)接受行政院農業委員會漁業署(下稱漁業署)委託代管梧棲漁港，欠缺相關管制措施，漁具倉庫旁空地及周邊圍牆遭堆置大量漁網(具)及其他廢棄物，未積極清除，影響漁港作業環境，經促請檢討改善，已分類清理完畢及加裝監視器監控，並派員加強巡查，改善港區整體環境。
海資所自民國(下同)99年12月起，每年接受漁業署委託辦理梧棲漁港清潔與安全維護工作，近3年度(105至107年度)委辦經費計1,973萬餘元，用以加強漁港管理，維持良好的漁業生產及漁港作業環境。臺中市審計處於107年10月9日查核發現，該所對於梧棲漁港之管理，欠缺相關管制措施，漁港漁具倉庫南側空地及港區東邊圍牆旁遭堆(棄)置大量漁網(具)及其他垃圾廢棄物等，總量約600噸，前經漁業署於106年4月6日公告，請所有人於106年5月31日前移除，逾期未移除者視同廢棄物，由該所逕予清除，惟已逾期1年餘仍未清除，影響漁港作業環境，經於108年1月4日函請檢討改善。
嗣經臺中市審計處追蹤後續改善情形，海資所已籌措經費71萬餘元辦理發包清除作業，自108年3月起陸續派工分類及清理梧棲漁港堆置廢棄漁網(具)及其他廢棄物，同年3月29日分類清理完畢，並於該區域加裝監視器監控及派員加強環境巡查，改善港區整體環境。