審計部臺灣省新竹市審計室(下稱新竹市審計室)查核發現，新竹農產運銷股份有限公司(下稱新竹農產公司)辦理蔬果農藥殘留檢驗作業，未就檢驗結果抑制率出現負值之異常情形進行重新檢驗程序，經促請檢討改善，已修正蔬果農藥殘留檢驗作業規範，落實防堵殘留農藥蔬果流通消費市場，提升農產食品安全。
新竹農產公司民國(下同)104至106年度平均每年蔬果交易量達3萬餘公噸，為竹竹苗地區主要農產品運銷流通中心，為減少上市農產品農藥殘留風險，均依行政院農業委員會農業試驗所研發之「農藥殘留快速檢驗技術」進行蔬果農藥殘留抽驗。新竹市審計室於107年4月查核發現，據農藥殘留快速檢驗試劑使用說明書列示，檢驗結果抑制率若連續3次以上出現負值或為-10％以下，可能係環境溫差變化影響或檢驗員操作出現錯誤，應重新檢驗。惟該公司106年度對於農藥殘留檢驗結果有上述情形者，均視為無農藥殘留，未予重新檢驗，經於107年6月1日函請檢討改善。
嗣經新竹市審計室追蹤改善情形，新竹農產公司於107年6月12日修正該公司交易蔬果農藥殘留檢驗作業規範，增訂農藥殘留檢驗抑制率負值情形之處理程序。經統計自修正規範後至108年4月底止，該公司就農藥殘留檢驗抑制率負值情形，已進行重新檢驗程序計36次，落實防堵殘留農藥蔬果流通消費市場，提升農產食品安全，維護民眾食的健康。