審計部臺灣省雲林縣審計室(下稱雲林縣審計室)查核發現，雲林縣政府為改善境內水患問題，辦理尖山大排等3件排水整治工程，價購沿線土地，惟未全部完成產權移轉登記，致部分土地重複價購；另於協議價購時誤繕土地面積而溢支價購金，均損及機關權益，經函請檢討改善，已完成產權移轉登記並收回溢支價金，確保政府財產權益。
雲林縣沿海地區地層下陷嚴重，平均潮水位高於內陸，其中流經口湖鄉與水林鄉之尖山大排、蔦松大排及牛挑灣溪，前於民國(下同)93年7月遭敏督利颱風侵襲潰堤，危及鄰近居民安全。雲林縣政府為改善該區域水患問題，辦理上開排水整治工程，並於99年2月以協議價購土地方式，支付臺灣雲林農田水利會(下稱水利會)土地價金3億餘元，取得103筆土地所有權狀。雲林縣審計室於103年12月查核發現，本案工程已於99年12月間完工驗收，惟其中83筆土地仍登記為水利會所有，不但損及政府權益，並衍生該府於97至102年間辦理尖山大排第1期下宜梧支線抽水站等計畫時，因工程基地內含前揭未辦理產權移轉登記之6筆土地，致該府向水利會重複價購上述土地，合計97萬餘元；又本案工程用地協議價購時，該府將其中1筆面積42.14平方公尺之土地，誤繕為4,214平方公尺，致溢支價購金351萬餘元等，經於104年1月12日函請該府研謀改善。
嗣經雲林縣審計室追蹤改善結果，雲林縣政府已於106年12月15日收回溢支土地價金448萬餘元，並由地政事務所重新出具分割清冊，於108年2月25日完成土地產權登記，另通報機關單位同仁注意，避免類此錯誤再次發生，以確保政府財產權益。