審計部臺灣省新竹市審計室(下稱新竹市審計室)查核發現，新竹市政府(下稱市政府)所屬部分機關自行收納款項內部審核作業未盡落實，且出納業務內部控制制度欠周延，增加現金收繳管理風險，經函請檢討改善，已修正相關作業規定，強化內部審核，健全出納作業內部控制。
市政府為執行收入憑證管理作業，於民國(下同)92年間訂定新竹市政府及所屬機關學校各項收入憑證管理要點(下稱收入憑證管理要點)；另為健全內部控制制度，於105年11月訂定出納、主計業務等內部控制制度共通性作業範例，控制重點及法令依據引用收入憑證管理要點等相關規定，以利所屬機關學校遵行。新竹市審計室於106年4月抽查發現，該府社會處等部分機關單位自行收納款項有繳庫日期延宕、金額異常，空白收據保管及領用作業未盡落實，收據格式勾稽覆核機制不足等情事；另出納管理手冊於94至105年陸續對收納款項解繳期限、自行收納款項收據及領用單之格式與管理、查核與監督等予以嚴謹規範，惟市政府未適時檢視修正收入憑證管理要點(已逾14年未修正)，部分規定已不合時宜，經於106年5月31日函請檢討改善。
嗣經新竹市審計室追蹤改善情形，市政府已檢討評估現金收繳風險，於106年8月修正收據格式及相關帳表以符合控制作業流程，強化主管覆核機制及增加實地檢核頻率；另於107年4月17日修正收入憑證管理要點，增訂自行收納款項收據及領用單之格式、保管、領用、各聯收執、作廢及銷毀等規範，健全各機關一致遵行出納業務內部控制制度。