審計部臺灣省基隆市審計室(下稱基隆市審計室)查核發現，連江縣政府辦理北竿橋仔碼頭整建及週邊改善工程，未能有效管控施工廠商機具調派情形及塊石材料出廠檢驗進度，致工程進度落後，經函請研謀改善，已完工開放使用，提升碼頭使用效益。
連江縣政府為改善北竿橋仔碼頭船席不足問題，促進觀光及漁業發展，提升橋仔碼頭整體港區使用效益，辦理北竿橋仔碼頭整建及週邊改善工程，規劃興建長50公尺、寬10公尺突堤碼頭一座。該工程於民國(下同)104年12月發包，決標金額7,400萬元，105年1月13日開工，預計106年3月31日竣工。基隆市審計室於105年9月查核發現，該府未能有效管控施工廠商工作平臺船調派不足情形，致主要工項沉箱結構工程施作進度落後；復未督促施工廠商依預定期限辦理塊石材料出廠檢驗，致延宕4個月仍未完成，影響工程作業推展，截至105年9月底實際進度為49％，較預定進度66.68％落後17.68個百分點，經於105年11月3日函請該府研謀改善。
嗣經基隆市審計室追蹤改善情形，連江縣政府已於105年11月督促施工廠商增派工作平臺船趕工，及加強管考工程進度，並於105年11月底完成塊石出廠檢驗。該工程已於106年8月28日竣工，並於同年9月21日驗收完成開放使用。據該府統計，106年10月至12月該碼頭進出計9,310人次，較105年同期7,760人次，增加19.97％，已提升碼頭使用效益。