審計部教育農林審計處（簡稱教育農林審計處）查核發現，科技部南部科學工業園區管理局（簡稱南科管理局）興建健康生活館，因興建量體過大及園區廠商自設運動場館競爭等因素，營運績效不彰，並有館舍閒置情形，經函請研謀改善。該局已重新招商委外營運，提升設施使用效能。
南科管理局為加強臺南園區生活機能，提高園區工作及生活環境品質，斥資6億餘元，於民國（下同）97年2月興建完成健康生活館，包括體育館、游泳池館及健身館，可提供室內籃球場、羽球場、溫水游泳池及健身房等室內健身娛樂設施，並自97年4月起以OT（Operate- Transfer；營運-移轉）方式委外營運。教育農林審計處查核發現，南科管理局未考量營運環境，審慎規劃健康生活館興建量體規模，復因園區廠商自設運動場館競爭，致委外營運廠商陷入營運困境而解約，於102年度收回自行營運，惟仍持續虧損且有健身館等館舍閒置未用情形，經於102年8月29日函請科技部督促提升資產運用效率與效益。
嗣經教育農林審計處追蹤改善情形，南科管理局已重新招商委外營運，契約期程自105年3月30日起至115年3月29日止，體育館、游泳館、健身館已分別於105年5月1日、7月1日及106年1月15日開始營運，有效提升設施使用效能。相較於該局自行營運，委外營運每年可減少虧損515萬餘元，並可挹注管理費及土地租金收入74 萬餘元。