審計部臺南市審計處(下稱臺南市審計處)調查發現，臺南市政府環境保護局(下稱環保局)推動柴油汽車排煙自主管理計畫，鼓勵主動檢驗粒狀污染物排放情形，惟僅1,072輛參與取得合格標章，成效欠佳，經函請研謀改善。取得標章者已達3,284輛，另設置11處空氣品質淨區，規定取得自主管理標章之柴油車始得進入，有效改善空氣品質。
現行汽車定期強制檢驗，僅檢驗車輛靜止狀態下之排煙污染程度，環保局為加強高污染性之柴油車行駛排煙檢驗，自民國(下同)96年起推動柴油汽車排煙自主管理計畫，鼓勵柴油大、小貨車及大客車主動到檢行駛排煙狀況，檢驗合格車輛發給自主管理標章，效期1年，遇路邊攔檢稽查時可優先放行。臺南市審計處102年10月調查發現，截至102年8月底止，全市僅1,072輛柴油車取得自主管理標章，而受政府補助經營市公車之客運業者均未加入自主管理，臺南市政府機關學校亦僅該局部分柴油清潔車加入，成效欠佳，經於102年12月函請研謀改善並持續追蹤督促執行。
嗣經臺南市審計處追蹤改善結果，市府已於103年6月規定所有機關學校車齡5年以上之柴油公務車及受補助之府城、新營及興南等3家客運業者均須加入自主管理，每年主動到檢外，亦於104年9月推廣鼓勵轄內公私立學校柴油車輛積極參與，並自105年起陸續將南部科學工業園區臺南園區等9個重要工業區及安平商港、台糖尖山埤江南渡假村等11處劃設為空氣品質淨區，規定取得自主管理標章之柴油車始得進入。截至106年7月底止，核發有效自主管理標章數已增加至3,284輛，較102年8月增加206％，據環保局估計每年可減少約23公噸以上細懸浮微粒之排放，有效改善空氣品質。