審計部交通建設審計處查核發現，交通部航港局(下稱航港局)對於船舶及小船逾期檢查裁罰尚無一致標準，經函請檢討，該局業已訂定「交通部航港局船舶及小船逾期檢查罰鍰裁量基準」，提升裁罰之公平性。
航港局係民國（下同）101年3月1日由前基隆、臺中、高雄及花蓮等4港務局合併改制成立，負責航政與港政公權力業務，並設有北、中、南、東航務中心等4個派出單位。該局102年底轄管船舶5,890艘、小船12,064艘，當年度申請檢查之船舶計有3,563艘次、小船5,966艘次，其中已逾期者船舶127艘、小船147艘。依船舶法規定，船舶及小船於特別檢查後，應於規定期限內向船舶所在地航政機關申請施行定期檢查，違反者，由航政機關處船舶所有人6,000元以上6萬元以下罰鍰，小船所有人3,000元以上3萬元以下罰鍰，並命其禁止航行及限期改善。審計部交通建設審計處查核發現，航港局各航務中心102年間對於逾期申請檢查之船舶及小船，或以最低罰款金額6,000元及3,000元裁罰，或以91年1月30日船舶法修正後未重新公告之「船舶逾期檢查罰鍰標準表」、「小船逾期檢查罰鍰標準表」作為裁罰準據，裁罰業務尚無一致標準，經函請檢討訂定。
嗣經審計部交通建設審計處追蹤結果，航港局業於104年1月30日以航舶字第1041710036-A號令訂定「交通部航港局船舶及小船逾期檢查罰鍰裁量基準」，並已依該裁量基準裁罰逾期檢查者，提升裁罰業務之公平性。