審計部交通建設審計處查核發現，交通部航港局(下稱航港局)將高雄港港區外土地租予臺灣港務股份有限公司（下稱臺灣港務公司），未依「國有公用不動產收益原則」第4點規定，按5％費率收取租金；又本案未報經主管機關同意，即轉租高雄市政府捷運工程局(下稱高雄市捷運局)供興建環狀輕軌及營運使用，均經函請檢討改善。航港局業收回該土地，並與高雄市捷運局簽訂租約及依規定費率計收租金，每年增裕國庫收入1千餘萬元。
審計部交通建設審計處查核發現，航港局將高雄港港區外面積24,574.71平方公尺之71筆土地，逕依「交通部航港局經管公有財產提供商港經營事業機構使用辦法」第3條規定，按土地當期申報地價2％之租金率出租予臺灣港務公司並簽訂土地租賃契約，未依「國有公用不動產收益原則」第4點規定按5％費率收取租金，且未於契約書中明定土地不得轉租，嗣臺灣港務公司高雄港務分公司（下稱高雄港務分公司）因高雄市捷運局興建環狀輕軌及營運需要，復未先依上開不動產收益原則第11點規定報請主管機關同意，即於102年5月將上開71筆位土地轉租予高雄市捷運局，租金則按當期土地申報地價5％計收，肇致高雄港務分公司102年5月至104年4月底獲取轉租差額利益達2,179萬餘元，經函請交通部督促檢討改善。
嗣經審計部交通建設審計處追蹤結果，航港局業收回該71筆土地，並於104年5月1日與高雄市捷運局簽訂租約，租金已依規定按當期土地申報地價5％計算，核算一個年度租金為1,816萬餘元，每年可增裕國庫收入1,089萬餘元。