審計部臺灣省澎湖縣審計室(以下簡稱澎湖縣審計室)查核發現，澎湖縣政府全球資訊網開放人民申辦案件服務系統更新後，未落實檢核新舊系統轉換資料完整性，亦未定期將新增服務項目資訊上傳至該系統，致網站公開申辦服務項目資訊與實際提供事項有差異，經建請研謀改善，該府業於網站新增168項申辦服務業務資訊及14項線上申請服務連結，並持續規劃提高線上申辦服務項目，提升行政透明度與便民服務效能。
澎湖縣政府為推展電子化政府及行政透明化工作，於該府全球資訊網站設置「申辦服務系統」供民眾線上即時查詢及申辦該府暨所屬機關提供之各項人民申辦案件資訊計257項，其中開放民眾線上申請服務者計59項。經澎湖縣審計室查核發現，該府於民國(下同)103年10月間辦理申辦服務系統更新後，未落實檢核新舊系統轉換資料完整性，亦未定期將新增服務項目資訊上傳至該系統，致網站公開之各類申辦服務業務項目與實際服務事項有差異，且未善加利用中央機關建置之網路服務資源提供便民服務，經建請研謀改善。
嗣經澎湖縣審計室追蹤澎湖縣政府改善結果，該府已促請所屬各機關單位重新檢核申辦服務系統登載資訊，將適合公開之服務資訊於網站公開，並定期追蹤考核所屬各機關單位辦理情形及逐步提高線上申辦服務業務項目數量。截至104年5月底止，該府網站申辦服務系統提供各類服務業務資訊總數已達425項，其中提供線上申請服務之連結總數計73項；同時運用行政院國家發展委員會「e管家」便民服務平台資源，加入104年e管家Plus「福利自己查」試辦縣市，配合國家發展委員會規劃期程，縣民可透過單一介面，輕鬆取得縣內154項與日常生活相關之個人化訊息及福利措施，強化便民服務範圍。