行政院環境保護署自民國(下同)89年起核定補助16個地方政府（含前臺北縣、臺中縣、臺南縣、高雄縣政府），設置28個轉運站、3處周邊工程，總計核定金額4億7,858萬餘元，累計撥款3億9,553萬餘元。經審計部規劃辦理專案調查結果，核有未妥為因應垃圾處理政策趨勢，及早研擬轉運站後續運作模式，致垃圾轉運站低度運作等效能過低情事，於101年6月26日依審計法第69條規定，函請行政院查明妥處，並報告監察院。案經監察院立案調查後，於103年1月8日糾正環保署，並由權責機關研提具體改善措施。本項專案調查攸關民生議題，爰彙整相關查核資料，撰具專案審計報告，以供各界參考。