審計部調查發現，部分市縣政府辦理菸酒檢舉及查緝獎勵金之核發，有非實際參與查緝人員獲配獎勵金，或實際參與查緝人員未獲配獎勵金等未盡妥適之處，經函請財政部研酌改善，該部已修正檢舉或查獲違規菸酒案件獎勵辦法，明定獎勵金應按參與者實際貢獻程度分配，暨受理檢舉機關應自接獲通知之次日起一個月內，通知檢舉人領取等規定。
財政部為強化菸酒查緝績效，爰於民國89年（以下同）訂定「檢舉或查獲違規菸酒案件獎勵辦法」。審計部於101年調查發現，部分市縣政府獎勵金核發作業，核有非實際參與查緝人員獲配獎勵金；實際參與查緝人員未獲配獎勵金，或部分協助人員獎勵金超過實際承辦人員獎勵金，未按員工貢獻程度分配情事；檢舉獎金因匿名或檢舉人未提供真實姓名，無法通知檢舉人限期領取；未積極通知檢舉人領取獎勵金，致獎勵金長期暫存機關專戶，爰於102年3月函請財政部研酌改善。
審計部追蹤改善結果，財政部已參酌建議，於103年5月22日修正「檢舉或查獲違規菸酒案件獎勵辦法」部分條文，以利各主辦查緝機關依循辦理菸酒檢舉及查緝獎勵金之核發作業。