花蓮縣政府為確保農業永續發展，促進農地合理利用，自民國(下同)89年起，依據農業發展條例規定，開放縣內農業用地興建農舍，截至98年底止，共核准興建700餘戶農舍。審計部臺灣省花蓮縣審計室調查發現，花蓮縣內多數農舍係供住宅使用，現況與農業經營無關，違反土地稅法第10條第1項及第22條有關免課徵地價稅之規定，經花蓮縣審計室函請花蓮縣地方稅務局全面清查妥處，以維租稅公平。
案經審計部臺灣省花蓮縣審計室追蹤結果，花蓮縣地方稅務局自98年起分年擬訂清查計畫，截至102年底止已針對花蓮縣境內6千多筆農舍進行清查，並將其中3,043筆農地改課地價稅，以維租稅公平，該5年合計增加縣庫稅收1,274萬餘元。