行政院公共工程委員會「重大公共建設計畫管理系統」與國家發展委員會「行政院政府計畫管理資訊網(GPMnet)」均係列管行政院所屬機關辦理重大公共建設計畫執行進度，兩系統對於計畫管制考核項目多所重疊，為簡化管考流程，經建請行政院督促整合重大公共建設計畫管制考核資訊平臺，已完成系統整併，有效提升行政效率。
行政院公共工程委員會為管控行政院所屬各機關辦理重大公共建設計畫，建置「重大公共建設計畫管理系統」，並規定各公共建設計畫主辦機關應指定專人，至該系統登錄各項計畫執行資料；另國家發展委員會為考核年度施政計畫，亦將公共建設計畫之管制與評核作業，納入「行政院政府計畫管理資訊網(GPMnet)」，規定各計畫主辦機關應填報執行進度及成果，檢討瞭解計畫達成目標及績效情形，作為繼續執行或改進該項計畫之參據。審計部查核發現，上開兩系統對於重大公共建設計畫管制考核項目多所重疊，例如執行進度、預算執行情形等項，為簡化行政作業，經函請行政院督促整合資訊平臺，以提升政府行政效率。
經審計部追蹤結果，行政院公共工程委員與國家發展委員會會已完成兩系統整併，自民國107年度起，行政院所屬各機關辦理重大公共建設計畫執行情形，統一填報於「行政院政府計畫管理資訊網(GPMnet)」，以簡化管考流程，有效提升行政效率。