新竹市政府(下稱市政府)輔導低污染未登記工廠業者辦理合法化作業，經審計部臺灣省新竹市審計室查核發現，市政府輔導納管家數及審查比率偏低，經函請研謀改善，已加速輔導納管及審查程序，有效提升未登記工廠申請納管家數及審查比率。
審計室指出，政府為兼顧在地型中小企業生存發展、勞工就業及環境保護，針對低污染既有未登記工廠採取納管、改善及變更用地等3階段輔導措施。依據工廠管理輔導法第28條之5規定，105年5月19日以前既有低污染未登記工廠，經主管機關同意納管，應於112年3月19日前提出工廠改善計畫，經政府輔導後，取得工廠登記。
然而，審計室於110年3月查核發現，截至109年底止，市政府列管既有低污染未登記工廠計194家，已申請納管者僅88家，申請納管率45.36％，未及5成；其中經審查完竣者52家，審查比率59.09％，未及6成，輔導納管作業及審查納管比率有待改善及提升，審計室遂於110年4月函請市政府檢討改善。
審計室表示，經追蹤改善情形，市政府已加速推動未登記工廠納管輔導及審查程序，截至113年6月底止，列管既有低污染未登記工廠計233家，已申請納管者215家，申請納管率92.27％，且均審查完畢，審查比率達100％，已較109年度有效提升；又已核准通過納管共177家，並收繳納管工廠納管輔導金共4,272萬元，將專用於未登記工廠之管理、輔導及周邊公共設施改善，加速未登記工廠完成改善。