新竹市稅務局(下稱稅務局)辦理房屋稅稽徵作業，經審計部臺灣省新竹市審計室查核發現，部分未依實際使用情形核課房屋稅，經函請檢討改善，已釐正稅籍資料，依法補徵稅款計470萬餘元，以維護租稅公平。
審計室指出，依據房屋稅條例第5條第1項第2款規定，房屋稅率之課徵，非住家用房屋：供營業、私人醫院、診所或自由職業事務所使用者，最低不得少於其房屋現值3％，最高不得超過5％；供人民團體等非營業使用者，最低不得少於其房屋現值1.5％，最高不得超過2.5％。復依財政部69年7月16日台財稅字第35758號函釋略以，房屋凡供營業用者，不論營利事業有否取得執照，均應按營業用稅率課徵房屋稅。
然而，審計室於111年11月查核發現，新竹市部分房屋實際有營業情形卻未依營業用稅率課徵房屋稅，部分無稅籍資料，又部分出租房屋仍按自住稅率課徵房屋稅，顯示稅籍資料列管欠周延，影響房屋稅核課之公平性及減損稅收，審計室遂於112年1月函請稅務局檢討改善。
審計室表示，經追蹤改善情形，稅務局已於112年11月完成稅籍清查及釐正稅籍資料，並依法補徵房屋稅492筆、稅額計470萬餘元，將持續加強房屋稅籍清查作業，以維護租稅公平。