交通部公路局（下稱公路局）辦理公路汽車客運偏遠服務路線營運虧損補貼，經審計部交通建設審計處查核發現，該局核定路線別最高補貼金額，未能精確反映實際營運成本，經函請研謀改善，已修正營運虧損補貼審議及執行管理要點，以提升業者經營誘因。
審計處指出，公路局為落實區域均衡發展，提升偏遠地區交通便利性，透過「公路公共運輸服務升級計畫（110－113年）」辦理公路汽車客運偏遠服務路線營運虧損補貼，交通部於111年4月12日核定準每車公里合理成本為41.325元，公路局據以計算核定各路線別最高補貼金額。
然而，審計處於112年2月查核發現，公路局辦理該營運虧損補貼，採單一價計算各路線別最高補貼金額，未審酌行駛區域、車種、車齡對車輛營運成本之影響，訂定差別補貼機制，難以精確反映實際營運成本，致部分公路汽車客運業者不堪虧損，陸續提出營運路線屆期不繼續經營，影響偏遠地區基本民行。審計處遂於112年6月建請公路局研謀改善。
審計處表示，經追蹤改善情形，公路局已於112年6月19日修正營運虧損補貼審議及執行管理要點，增訂最高補貼金額計算之但書，個別路線如有特殊營運背景，得視實際狀況個案審議辦理，俾因地制宜彈性調整，以提升業者經營誘因。