新竹縣政府(下稱縣政府)辦理「新竹縣動物保護教育園區」(下稱動保園區)興建工程，經審計部臺灣省新竹縣審計室查核發現，動保園區未設置隔離作業區與特殊留置區，衍生收容動物感染風險，經函請檢討改善，已規劃設置特殊留置區及隔離作業區，提供優質動物收容環境。
審計室指出，縣政府為改善既有動物收容處所防疫設計不良問題，經爭取前行政院農業委員會（112年8月1日改制為農業部）補助辦理動保園區興建工程，計畫總經費7,610萬餘元，設置犬貓收容房舍、動物手術室及動物互動場所等處所。
然而，審計室於110年11月查核發現，縣政府辦理動保園區興建工程，未依動物收容處所設置組織準則規定，於建築物內規劃設置隔離作業區與特殊留置區，係沿用尚未拆除之舊有房舍已設置之隔離作業區及傷病、哺乳、幼年動物之特殊留置區，又該舊有隔離及留置區係屬同一空間且無隔離措施，衍生病犬及幼犬感染風險，審計室遂於110年12月23日促請縣政府檢討改進。
審計室表示，經追蹤改善情形，縣政府已於111年4月於動保園區手術室旁之住院室設置特殊留置區，減少術後動物之運送路程，另一樓靠近出入口犬舍作為隔離作業區，減少新進動物之病源傳播，動保園區興建工程於112年4月20日完工、同年5月17日完成驗收，提供優質動物收容環境。