澎湖縣政府農漁局（下稱農漁局）處理養殖牡蠣產業廢棄蚵殼事宜，經審計部臺灣省澎湖縣審計室查核發現，馬公市菜園地區長年堆置之廢棄蚵殼仍待妥適處理，經函請檢討改善，已清除堆置之廢棄蚵殼，維護環境衛生及整潔。
審計室指出，澎湖縣馬公市、白沙鄉等地區養殖牡蠣產業發達，每年產生2,000至3,000公噸廢棄蚵殼，並因缺乏處理場所，尚有歷年大量未處理之廢棄蚵殼亟待去化，農漁局為產業永續發展，於109年間輔導白沙鄉公所設置營運蚵殼暫置場，處理養殖牡蠣廢棄物。
然而，審計室於111年3月查核發現，農漁局雖已輔導白沙鄉公所設置蚵殼暫置場持續收容廢棄蚵殼，再交由再利用業者回收再利用或運至土資場回填，但馬公市養殖牡蠣產業衍生之廢棄蚵殼，仍長年堆置於鄰近菜園漁港之臨時暫置場，且馬公市公所原預計清運8,220立方公尺廢棄蚵殼至縣政府設置之土資場，亦因原編列經費不足，致無法及時處理，截至111年4月底止，大量堆積之廢棄蚵殼仍未清運，並影響環境衛生及整潔，審計室遂於111年5月函請研謀改善。
審計室表示，經追蹤改善情形，農漁局已於112年1月10日獲行政院農業委員會漁業署補助相關經費，並輔導馬公市公所逐步清運，截至112年6月底止，長年堆置臨時暫置場之8,220立方公尺廢棄蚵殼，均已清運至土資場回填，有效維護環境衛生及整潔。