南投縣政府稅務局(下稱稅務局)辦理地價稅及房屋稅稽徵作業，經審計部臺灣省南投縣審計室查核發現，部分稽徵案件未依實際使用情形核課稅捐，經函請檢討改善，已釐正稅籍並依法補徵稅款323萬餘元，維護租稅公平。
審計室指出，依土地稅法第14條規定，已規定地價之土地，除依第22條規定課徵田賦者外，應課徵地價稅。又依財政部79年6月18日函釋，課徵田賦之農業用地，在依法辦理變更用地編定或使用分區前，變更為非農業使用者，應自實際變更使用之次年期起改課地價稅；房屋稅條例第5條規定，房屋稅依住家用及非住家用，按不同稅率課徵。
然而，審計室於110年9月查核發現，部分停徵田賦土地非作農業用途使用，未依規定改課地價稅；農業用地違規使用，地價稅仍按田賦課徵；房屋稅以自用住宅稅率課徵，惟間有營業人設籍未辦理稅率改課；部分合法或臨時工廠課徵房屋稅面積小於廠房面積；部分建築物使用執照所載房屋構造種類與房屋稅籍資料不一等情事，審計室遂於 110年11 月函請稅務局檢討改善。
審計室表示，經追蹤改善情形，稅務局已於112年4月完成清查及釐正相關稅籍資料，並補徵地價稅或房屋稅計378筆、金額323萬餘元，並將加強蒐集課稅資料，積極辦理查核作業，以維護租稅公平。