臺東縣稅務局(下稱稅務局)辦理房屋稅稽徵作業，經審計部臺灣省臺東縣審計室查核發現，部分稽徵案件未依實際使用情形核課稅捐，經函請檢討改善，已釐正稅籍資料，並依法補徵或改課房屋稅計354萬餘元，以維護租稅公平。
審計室指出，依臺東縣房屋稅徵收自治條例第3條規定，供營業、私人醫院、診所或自由職業事務所使用房屋，稅率為3％；依法登記之工廠，自有供直接生產使用之房屋，按營業用房屋減半徵收；人民團體等非住家非營業用房屋，稅率為2％。另臺東縣簡化評定房屋標準價格及房屋現值作業要點第4點規定，稽徵機關核計房屋現值時，對房屋之構造、總層數及面積等，應依建築管理機關核發之使用執照所載資料為準。同要點第17點規定，房屋設有電梯(升降機)者，依電梯設備工程費概算表內之價格評定。
然而，審計室於110年9月查核發現，臺東縣轄內部分房屋供已立案短期補習班使用，惟未依非住家非營業用稅率課徵，或核課面積短計；建築物設有升降設備，卻查無課稅資料；營業中工廠核課營業用減半徵收面積大於廠房登記總面積；營業人設籍之房屋仍按住家用稅率課徵；房屋核課之課稅面積、構造別及總層數，與依使用執照等辦理之建物登記資料不符或存有差異；供未登記寺廟及未立案神壇使用房屋，仍按住家用稅率課徵等情事，審計室遂於111年1月函請稅務局查明適法妥處。
審計室表示，經追蹤改善情形，稅務局已於112年3月完成清查及釐正房屋稅稅籍資料，並依法補徵或改課房屋稅計243件、金額354萬餘元，嗣後將加強辦理房屋稅稅籍資料與其他內、外部資料之橫向勾稽作業，以維護租稅公平。