國防部所屬人員兼職及領受兼職酬勞情形，經審計部查核發現，該部未落實清查及管控兼職及領受兼職酬勞情形，致有兼職人員領受兼職費以外之獎金，經函請檢討改善，業研提改善措施，管制所屬人員兼職及領受人事給與情形。
審計部指出，依軍公教人員兼職費支給表（下稱兼職費支給表）規定及行政院人事行政總處釋示，政府機關代表之兼職費，一律由兼職人員本職機關（構）學校轉發，不得由兼職機關（構）學校直接支給，但採電連存帳方式支付兼職費，並經兼職機關函知本職機關（構）學校者，不在此限；本職機關（構）學校應確實依規定列冊，並審核登記兼職及兼職費領受情形。另軍公教人員受聘兼任行政法人董監（監）事職務，基於其兼職所產生之工作對價，除得依規定支領兼職費外，尚不合支領其他酬勞。
然而，審計部於110年4月查核發現，國防部所屬軍、文職人員兼任國家中山科學研究院（下稱中科院）第3屆董（監）事者計11人，惟國防部未依規定落實清查及管控所屬人員兼職情形、兼職數目及領受兼職酬勞情形，致中科院109年度核發兼職董（監）事兼職費，係以直接匯入董（監）事帳戶方式辦理，未依規定函知國防部；另107至109年國防部所屬軍、文職人員兼任中科院董（監）事，領受獎金者計97人次，與相關規定未合，審計部遂於110年6月函請國防部妥適處理。
審計部表示，經追蹤改善情形，國防部已全面清查所屬人員兼任中科院董（監）事及領受兼職費情形，並請中科院自110年7月起依規定函知兼職人員之本職機關後，由軍備局會知該部有關單位錄知管制，及每年依規定辦理所屬公務人員兼職調查作業，以管制所屬軍文職兼職情形；另中科院針對國防部屬員兼任董（監）事人員，自110年12月起，除兼職費外不再發給其他酬勞，國防部並將於年度輔訪時機查察執行辦況。